Lugar de nacimiento del talmudista Menahem ben Zéraj y residencia durante años del  poeta Moisés ibn Ezrá. La judería en sus comienzos se estableció en el barrio de Olgacena, que ocupaba un cerro frente y al lado del montículo donde se alzaba el castillo. No quedan restos ni de la judería ni del barrio, donde existía una Sinagoga que en el siglo XII fue convertida en Iglesia de Todos los Santos, para más tarde edificarse en su lugar el monasterio de Santo Domingo, cuyas ruinas, hoy restauradas, dominan la ciudad. En 1135 los judío tuvieron que "donar" un terreno que les pertenecía a las autoridades eclesiásticas, para que pudieron edificar allí la Iglesia del Santo Sepulcro, que existe hasta el día de hoy. En 1144 padecieron una nueva expoliación, cuando fueron obligados a entregar la sinagoga para crear en ella la Iglesia de Santa María. Las crónicas señalan que los judíos eran preferentemente curtidores, campesinos, plateros, tintoreros y peleteros. Dos familias sobresalían en el panorama local: la de Levi, que fue recibidor entre 1363 y 1392, y la Orabuena, médico y gran rabino y físico allegado al rey Carlos II, que más tarde financió las obras del gran palacio real de la ciudad. Es interesante señalar que la comunidad debía ser muy ilustrada, ya que en la nómina de los judíos que residían en Estella figuraba un solo analfabeto, Samuel Benosillo… La sinagoga que en siglos inmediatos tendría la poderosa judería de Estella, seguramente desapareció cuando en 1328 los vecinos de esta villa, ayudados de las gentes de la comarca, y amparados en la anarquía al fallecimiento del rey Carlos I, acometieron el barrio judío, acuchillaron a sus moradores y redujeron a cenizas sus edificios. En 1912 se halló un fragmento de lápida hebrea del siglo XI o XII al pie del castillo de Belmecher, lo que ha dado pie a suponer la localización en dicho lugar del cementerio judío. Este fragmento está depositado en el Museo de Navarra, en Pamplona.